吉林医药学院1952年建校，前身为中国人民解放军第四军医大学吉林军医学院。2004年8月，学校由军队整体移交吉林省，成为省属公办高等学校，现为吉林省惟一独立设置的西医本科院校。2013年通过教育部本科教学工作合格评估，2017年通过教育部临床医学专业认证，有效期6年。学校现为吉林省硕士学位授权单位立项建设A类高校。
学校现有19个党政机关、3个群团组织、14个教学单位、5个教辅单位、1个省级科技协同创新中心;2所附属医院(第一临床医学院附属四六五医院、第二临床医学院附属梅河口市
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