中国科学院大学及各培养单位都有广泛的国际合作与交流。国科大与哈佛大学、麻省理工大学、东京大学、德国马普学会、法国国家科研中心等多家著名科教机构建立了密切联系和合作关系。2010年，与丹麦科技创新部、丹麦高校联盟共建中丹科教中心项目取得进展，目前还组建了中丹学院，招生硕士和博士研究生；还与美国内布拉斯加大学、瑞典国家高等教育署、荷兰格罗宁根大学、澳大利亚昆士兰大学、联合国教科文卫组织、沙特阿卜杜拉科技大学建立合作关系，学生的专业如有涉及，都有出国深造或参加学术会议的机会。
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